Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi mezunu olan Aytekin Oğuz, iç hastalıkları uzmanlık eğitimini Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesinde tamamlamıştır. İç hastalıkları alanında 1988 yılında Klinik Şef Yardımcısı, 1992’de Doçent, 1993’de Klinik Şefi, 1997’de Profesör ünvanlarını almıştır. Ülkemizde Ankara, Sivas, Manisa, Kocaeli ve İstanbul’da, yurt dışında Misafir Profesör olarak İngiltere’de “Leeds General Infirmary, Diabetes Clinics”te çalışmıştır.
Prof. Dr. Aytekin Oğuz, 2000-2023 yılları arasında İstanbul Göztepe Eğitim ve Araştırma Hastanesi ve İstanbul Medeniyet Üniversitesi Tıp Fakültesi’nde (2012-2023) İç Hastalıkları Anabilim Dalı Başkanı olarak görev yapmıştır. Aynı üniversitede Beslenme ve Metabolizma Anabilim Dalı’nı kurarak Beslenme ve Metabolizma Doktora Programını yönetmiştir. Dr. Aytekin Oğuz 23 yıl süreyle İstanbul Göztepe Eğitim ve Araştırma Hastanesi (yeni adıyla Göztepe Prof. Dr. Süleyman Yalçın Şehir Hastanesi) Diyabet, Hipertansiyon, Kolesterol Poliklinikleri sorumluluğunu yürütmüştür.
Aytekin Oğuz, Metabolik Sendrom Derneği, Kardiyometabolik Sağlık Vakfı ve Güncel Tıp Derneği başkanıdır. Türkiye Tıp Akademisi, Türk İç Hastalıkları Uzmanlık Derneği, Türk Diyabet Cemiyeti, Diyabet Obezite ve Beslenme Derneği, uluslararası derneklerden, Avrupa Ateroskleroz Derneği ve Avrupa Hipertansiyon Derneği üyesidir.
Avrupa Hipertansiyon Derneği tarafından Avrupa Hipertansiyon Uzmanı olarak sertifikalandırılmıştır.
Diyabet, hipertansiyon, kolesterol ve metabolik sendrom alanlarında kitapları, ulusal ve uluslararası 200’den fazla yayını vardır.